Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
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SMG1Q96Q15 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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