Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC47Q96A33 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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