Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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