Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC142Q17RM4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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