Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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