Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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PTPRNQ16849 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRNQ16849 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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