Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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