Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VAMP3Q15836 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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