Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
SKIV2LQ15477 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SKIV2LQ15477 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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