Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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