Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PUM3Q15397 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PUM3Q15397 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PUM3Q15397 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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