Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
EBI3Q14213 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms