Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCARB2Q14108 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARB2Q14108 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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