Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H3Q13889 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms