Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SF3B2Q13435 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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