Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SP140Q13342 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SP140Q13342 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SP140Q13342 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms