Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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