Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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