Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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