Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms