Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms