Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1Q9UJ41 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1Q9UJ41 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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