Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GDE1Q9NZC3 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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