Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GDAP2Q9NXN4 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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