Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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SAMD8Q96LT4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SAMD8Q96LT4 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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SAMD8Q96LT4 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SAMD8Q96LT4 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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