Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms