Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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