Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SP6Q3SY56 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms