Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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RTL8BQ17RB0 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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RTL8BQ17RB0 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RTL8BQ17RB0 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
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