Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIST2H2ACQ16777 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HIST2H2ACQ16777 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms