Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms