Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNCBQ16143 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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