Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms