Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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NEDD8Q15843 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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NEDD8Q15843 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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NEDD8Q15843 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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NEDD8Q15843 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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NEDD8Q15843 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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