Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ALX1Q15699 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ALX1Q15699 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ALX1Q15699 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms