Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHHQ15465 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHHQ15465 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SHHQ15465 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHHQ15465 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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