Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms