Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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