| SEMA3A | Q14563 | SNORD73A-201 | ENST00000386062 | 65 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF4EBP2P3-201 | ENST00000403144 | 334 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6ATAC40P-201 | ENST00000408580 | 137 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-293P-201 | ENST00000411259 | 106 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01870-201 | ENST00000427042 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | INTS6-AS1-201 | ENST00000434512 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02264-201 | ENST00000442020 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HIGD1AP2-201 | ENST00000446367 | 280 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL27AP5-201 | ENST00000469428 | 449 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL31P41-201 | ENST00000477967 | 372 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS29P20-201 | ENST00000489592 | 171 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS27AP10-201 | ENST00000496103 | 208 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC096745.1-201 | ENST00000509945 | 370 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | VTRNA2-2P-201 | ENST00000516091 | 103 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC109479.2-201 | ENST00000517842 | 174 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MDM2-221 | ENST00000517852 | 393 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL359237.1-201 | ENST00000554305 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012229.1-201 | ENST00000558699 | 499 nt | TSL 4 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC107871.2-201 | ENST00000612894 | 502 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC073346.2-201 | ENST00000624724 | 2058 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008264.2-201 | ENST00000610193 | 3731 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC110491.1-201 | ENST00000562191 | 2010 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005592.1-201 | ENST00000566527 | 1640 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-379P-201 | ENST00000363813 | 104 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU5E-7P-201 | ENST00000365290 | 117 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445529.1-201 | ENST00000398713 | 389 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01201-201 | ENST00000412420 | 294 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DPH3P2-201 | ENST00000422618 | 250 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009414.1-201 | ENST00000427200 | 443 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL157937.1-201 | ENST00000435092 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL135923.2-201 | ENST00000435444 | 501 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093083.1-201 | ENST00000438633 | 347 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01162-201 | ENST00000447262 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL031274.1-201 | ENST00000450334 | 232 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012308.1-201 | ENST00000451232 | 178 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL353752.1-201 | ENST00000454946 | 260 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008885.1-201 | ENST00000514930 | 301 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.687-201 | ENST00000516558 | 91 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SCARNA13-201 | ENST00000516672 | 275 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-54P-201 | ENST00000517181 | 120 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.721-201 | ENST00000517207 | 102 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OOSP2-203 | ENST00000532905 | 496 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010186.2-204 | ENST00000537668 | 439 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGN2P15-201 | ENST00000585707 | 270 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL451007.1-201 | ENST00000595491 | 289 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091953.5-201 | ENST00000622919 | 233 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SEL1L2-201 | ENST00000284951 | 2224 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PRB2-201 | ENST00000389362 | 1429 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LPP-221 | ENST00000618621 | 18277 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LPP-222 | ENST00000640853 | 18277 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF72P-201 | ENST00000425869 | 1908 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.2-201 | ENST00000362330 | 96 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.106-201 | ENST00000363189 | 100 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.307-201 | ENST00000365022 | 117 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1280P-201 | ENST00000365211 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1329P-201 | ENST00000365664 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.396-201 | ENST00000383949 | 103 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-72P-201 | ENST00000384285 | 79 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-823P-201 | ENST00000391042 | 103 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1109P-201 | ENST00000391187 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BPY2DP-201 | ENST00000422208 | 265 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CEP57L1P1-201 | ENST00000430943 | 1201 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS15AP10-201 | ENST00000432472 | 382 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL024508.1-201 | ENST00000432477 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008080.3-201 | ENST00000440074 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CYCSP32-201 | ENST00000440548 | 321 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098831.1-201 | ENST00000440661 | 216 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PLCB1-IT1-201 | ENST00000441231 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC124916.1-201 | ENST00000444020 | 547 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL020998.1-201 | ENST00000444923 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC105758.1-201 | ENST00000506038 | 399 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-377P-201 | ENST00000515965 | 102 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.668-201 | ENST00000516233 | 93 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP40-201 | ENST00000517211 | 242 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104576.1-201 | ENST00000524225 | 88 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP004607.1-201 | ENST00000524456 | 203 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC022690.2-201 | ENST00000525673 | 589 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PWRN1-203 | ENST00000564898 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC024270.4-201 | ENST00000570202 | 421 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C18orf54-203 | ENST00000578138 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC096577.2-201 | ENST00000611455 | 153 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR4C15-202 | ENST00000642128 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MCMDC2-201 | ENST00000313616 | 2043 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL445259.1-201 | ENST00000587106 | 2984 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CACNB4-238 | ENST00000636901 | 7706 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SMARCAD1-206 | ENST00000509418 | 2348 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEUP1-202 | ENST00000525646 | 1920 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CATSPERB-201 | ENST00000256343 | 3623 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR22-201 | ENST00000362190 | 85 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.48-201 | ENST00000362710 | 103 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNY3P11-201 | ENST00000364153 | 102 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA51.4-201 | ENST00000364993 | 124 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.389-201 | ENST00000383924 | 113 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MORN2-203 | ENST00000409131 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP274-201 | ENST00000410484 | 108 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |