Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3AQ14563 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SEMA3AQ14563 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3AQ14563 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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