Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHROOM2Q13796 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SHROOM2Q13796 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms