Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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TCIRG1Q13488 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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