Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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