Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEMA3FQ13275 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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