Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NME3Q13232 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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NME3Q13232 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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NME3Q13232 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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NME3Q13232 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NME3Q13232 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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