Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CALCOCO2Q13137 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms