Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF3Q13114 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF3Q13114 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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TRAF3Q13114 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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TRAF3Q13114 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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