Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms