Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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