Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CENPFP49454 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
CENPFP49454 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CENPFP49454 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CENPFP49454 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CENPFP49454 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CENPFP49454 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CENPFP49454 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms