Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CRXO43186 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CRXO43186 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CRXO43186 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CRXO43186 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CRXO43186 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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